LOGICIEL R / R STUDIO Construction de packages Mixte : présentiel / à distance

• oute personne souhaitant se perfectionner dans l'utilisation du logiciel R dans un contexte de création et de partage de packages.

• Il est nécessaire que l'apprenant soit déjà un utilisateur du logiciel R. La création et la manipulation des objets sous R, l'importation des données, l'utilisation de R en mode script ou en mode console, la connaissance de la programmation sous R sont des prérequis essentiels pour s'inscrire à cette formation.

A l'issue de cette formation, l'apprenant sera capable de :

• Créer un package avec R Studio
• Décrire le package
• Ajouter des données au package
• Créer et ajouter des fonctions
• Documenter le package, décrire les données et les fonctions du package
• De tester le package
• Partager le package
• Créer des vignettes

Créer un package avec R Studio

• Découverte du package devtools
• Description de l'arborescence d'un package
• Création d'un premier package simple « Bonjour les stagiaires » en 5 étapes :
• Extraction des éléments : à partir des indices, par le biais de conditions
  • Installation des packages nécessaires
  • Création de l'emplacement du package
  • Ajout de fonction très simple
  • Ajout d'une courte documentation
  • Installer le package en local

Ajout de données au package

• Utilisation des fonction use_data_raw() et use_data()
• Télécharger les données manuellement

Création et ajout de fonctions

• Rappel des fondamentaux de la programmation
• Boucles
• Conditions
• La vectorisation et les fonctions de type apply : apply, tapply…

Décrire et documenter le package, décrire les données et les fonctions du package

• Découverte du package roxygen2
• Les éléments à décrire
• Le langage rmarkdown
• Tricoter (ou knitr) un fichier de description

Création de vignettes

• Exemple et intérêt des vignettes
• Ecriture d'une vignette
• Attentes du CRAN sur les vignettes
• Trucs et astuces

Partage du package

• Dépôt du package sur GitHub
  • Création d'un compte github
  • Installation de Git
  • Création d'un dépôt distant ("repo") sur GitHub
  • Commandes Git
  • Installation du package depuis GitHub (dev version)
• Soumettre un package sur le CRAN

• Créer un package avec R Studio
• Décrire le package
• Ajouter des données au package
• Créer et ajouter des fonctions
• Documenter le package, décrire les données et les fonctions du package
• De tester le package
• Partager le package
• Créer des vignettes

• Explications théoriques suivies de pratiques guidées puis de mises en autonomie.
• Exercices autonomes et réguliers pour assurer l'assimilation

Votre formation a lieu en présentiel :

• 1 vidéoprojecteur par salle
• 1 ordinateur

Votre formation se déroule à distance avec :

• 1 ordinateur
• 1 connexion Internet
• 1 adresse e-mail valide
• 1 équipement audio (micro et enceintes ou casque)
• 1 Webcam (facultatif – dans l'idéal)
• 1 deuxième écran (facultatif – dans l'idéal)

Votre formation se déroule sur notre plate-forme de formation avec :

• 1 ordinateur
• 1 connexion Internet
• 1 adresse e-mail valide
• 1 équipement audio (micro et enceintes ou casque - facultatif)

Support stagiaire :

À l'issue de la formation, les exercices et travaux pratiques réalisés, leurs corrigés ainsi qu'un support de cours dématérialisé sera fourni à chaque stagiaire par e-mail ou via la plate-forme FOAD.