LOGICIEL R / R STUDIO Graphiques : Commandes de bases et initiation au package ggplot2 Mixte : présentiel / à distance

• Toute personne souhaitant maîtriser les principales fonctionnalités permettant de générer et modifier des graphiques sous R avec les outils de base ainsi qu'avec l'usage de ggplot2

• Il est nécessaire que l'apprenant ait les connaissances de bases sur le logiciel R : création et manipulation des objets sous R, importation des données (.csv, .xls, .xlsx…), utilisation de R en mode script…

A l'issue de cette formation, l'apprenant sera capable sous R de :

• Lire et écrire des scripts « avancés » permettant de créer et de modifier des graphiques
• Utiliser les commandes de bases afin de créer les graphiques suivants : nuages de points, boîtes à moustaches, histogramme des fréquences, QQ-plot, graphique des moyennes avec barres d'erreurs …
• Utiliser les commandes du package ggplot2 afin de créer et modifier des graphiques évolués et esthétiques
• Modifier un graphique en vue de le publier : titres, couleurs, axes, épaisseur des tracés…
• Ajouter des éléments au graphique : points, lignes, barres d'erreurs, texte, légende…
• Partitionner la fenêtre graphique
• Sauvegarder un graphique dans les dimensions souhaitées et au format souhaité : pdf, png, jpeg, eps…

Rappels sur les fondamentaux sur le logiciel R

• Lire efficacement l'aide en ligne des commandes
• Rechercher les commandes
• Installation et chargement d'un package
• Importation sous R des données
  • Contenues dans un fichier.csv
  • Contenues dans un classeur Excel
• Extraction d'une colonne d'un data frame
• Trucs et astuces

Création de graphiques à l'aide des commandes de bases sous R

• Documentation en ligne
• Les différentes commandes de création du graphique principal
  • plot
  • boxplot
  • stripchart
  • hist
  • barplot
  • pairs
  • …
• Opérateur ~
• Modification du graphique
  • Couleur
  • Police
  • Titre du graphique
  • Noms des axes
  • Echelle des axes
  • Type de points
  • Epaisseur des traits
  • ….
• Ajout d'éléments au graphique
  • Texte
  • Points
  • Ligne
  • Flèches ou barres d'erreurs
  • Légende
  • Utilisation de la commande locator pour afin de placer des éléments sur un graphique
• Paramétrage général des graphiques : commande par
• Partitionnement de la fenêtre graphique
• Sauvegarde du graphique au format souhaité (jpeg, png, pdf…)
• Questions / réponses

Introduction au package ggplot2

• Principe général
• Avantages et inconvénients
• Lecture de l'aide en ligne des commandes du package ggplot2
  • Options spécifiques de la commande
  • Options d'esthétiques de la commande
• qplot vs ggplot

Créer et modifier des graphiques en utilisant le package ggplot2

• Présentation et utilisation des principales commandes du package ggplot2
  • Commandes qplot, ggplot et aes
  • Type de graphique : commandes geom_...
  • Utilisation de calculs statistiques : commandes stat_...
  • Modification des axes : commandes scale_...
  • Modification des thèmes : commandes ggttile, xlab, labs, theme_...
  • Gestion de la légende : commande guides
  • Ajout de texte: commande annotate
• Options spécifiques des commandes
  • geom_boxplot
  • geom_jitter
  • geom_line
  • geom_errorbar
  • …
• Présentation et utilisation des principales options d'esthétique : ü Transparenceü Couleurü Tailleü Type de pointsü Type de lignesü …
• Partitionnement de la fenêtre graphique• Sauvegarde du graphique au format souhaité (jpeg, png, pdf…)

• Lire et écrire des scripts « avancés » permettant de créer et de modifier des graphiques
• Utiliser les commandes de bases afin de créer les graphiques suivants : nuages de points, boîtes à moustaches, histogramme des fréquences, QQ-plot, graphique des moyennes avec barres derreurs
• Utiliser les commandes du package ggplot2 afin de créer et modifier des graphiques évolués et esthétiques
• Modifier un graphique en vue de le publier : titres, couleurs, axes, épaisseur des tracés
• Ajouter des éléments au graphique : points, lignes, barres d'erreurs, texte, légende
• Partitionner la fenêtre graphique
• Sauvegarder un graphique dans les dimensions souhaitées et au format souhaité : pdf, png, jpeg, eps

• Explications théoriques suivies de pratiques guidées puis de mises en autonomie.
• Exercices autonomes et réguliers pour assurer l'assimilation

Votre formation a lieu en présentiel :

• 1 vidéoprojecteur par salle
• 1 ordinateur

Votre formation se déroule à distance avec :

• 1 ordinateur
• 1 connexion Internet
• 1 adresse e-mail valide
• 1 équipement audio (micro et enceintes ou casque)
• 1 Webcam (facultatif – dans l'idéal)
• 1 deuxième écran (facultatif – dans l'idéal)

Votre formation se déroule sur notre plate-forme de formation avec :

• 1 ordinateur
• 1 connexion Internet
• 1 adresse e-mail valide
• 1 équipement audio (micro et enceintes ou casque - facultatif)

Support stagiaire :

À l'issue de la formation, les exercices et travaux pratiques réalisés, leurs corrigés ainsi qu'un support de cours dématérialisé sera fourni à chaque stagiaire par e-mail ou via la plate-forme FOAD.