Vocabulaire, objectifs et contraintes liée aux outils statistiques appliqués à l'expérimentation animale
- Les variables en jeux
- Les variables réponses
- Les variables facteurs
- Les variables blocs
- Les variables bruits
- Les contraintes
- Contraintes de coûts
- Contraintes éthiques
- Niveaux d'exigence de qualité des analyses statistiques
- Les objectifs de l'expérimentation animale
- Détection de facteurs influents
- Compréhension des interactions entre facteurs
- La modélisation (prédiction, optimisation)
- Les objectifs de l'organisation du schéma expérimental
- Sélection des essais à réaliser
- Déterminer le nombre de répétitions nécessaires
- Organiser les essais en tenant compte des contraintes expérimentales
- Garantir un niveau de qualité statistique pertinent
- Maitrise des risques associés à la pratique expérimentale
- Risque d'erreur expérimentale pure
- Risque statistique due à l'erreur d'échantillonnage (risques alpha, béta)
- Risque de confusions entre effets
- Solutions apportées
- Erreur de mesure
- Erreur de répétabilité
- Erreur de reproductibilité
- Identifier les conditions de mesurage
Mise en œuvre et interprétation des résultats des analyses statistiques
- Type de variables : variables qualitatives vs variables quantitatives
- Outils de statistiques descriptives
- Grandeurs de position
- Grandeurs de dispersion
- Outils graphiques
- Statistique inférentielle - De l'échantillon à la population
- Intervalle de confiance
- Techniques d'estimations
- Tests d'hypothèses
- Démarche
- Vocabulaire
- Risques associés aux décisions
- Lien entre décisions statistiques et protocole expérimental
- L'analyse de la variance
- Objectif de l'Anova
- Lien entre protocole expérimental et Anova
- Erreurs à ne pas commettre dans l'Anova
- Analyse des effets des facteurs
- Analyse des effets des interactions
- Anova sur mesures répétées
- Tests post-hoc
Structuration d'un protocole expérimental
• Structure des essais
• Plan à un facteur
• Plans à plusieurs facteurs
• Plans croisés
• Plans parallèles
• Plans équilibrés
• Plans à mesures répétées
• Plans avec blocs
• Problématique des plans déséquilibrés
• Calcul du nombre de sujets et du nombre de répétitions
• Puissance d'un protocole expérimental
Puissance de test et calculs des tailles d'échantillons
- Définitions du risque beta et de la puissance de test
- Lien entre le risque alpha, le risque beta et la puissance de test
- Lien entre la puissance de test et le delta détectable (ou détecté)
- Illustrations graphiques des différents liens (alpha, beta, delta, écart-type, n)
- Les 3 stratégies selon les contextes :
- Calculer le n
- Calculer la puissance
- Calculer l'effet
- Dimensionnement d'un test de comparaison de 2 moyennes type Student
- Dimensionnement d'un test de comparaison de k moyennes type Anova
- Dimensionnement d'un test de comparaison de proportions type Khi ², Fisher's exact